Laboratori de Biotecnologia i ciències òmiques

Genòmica, Transcriptòmica i Epigenòmica:

• Seqüenciació del genoma sencer amb lectures curtes (Illumina)
• Seqüenciació del genoma sencer amb lectures llargues (ONT)
• Seqüenciació enzimàtica de metiloma enter del genoma (epigenòmica)
• Seqüenciació dirigida
• Seqüenciació d’ARN amb lectures curtes (Illumina)
• Seqüenciació d’ARN amb lectures llargues (ONT)
• Seqüenciació d’ARN petit
• Seqüenciació de Xip
• Confirmació de variants per seqüenciació de Sanger
• Empremta digital d’ADN mitjançant seqüenciació del genoma sencer i anàlisi de fragments
• Seqüenciació metagenòmica per genoma sencer i seqüenciació basada en amplicó (16S, 18S o ITS).
• Seqüenciació dirigida de petits fragments mitjançant electroforesi capil·lar
• Anàlisi de fragments per electroforesi capil·lar
• Expressió gènica dirigida
• Anàlisi de genotips de Taqman SNP
• Expressió gènica o anàlisi de miRNA mitjançant bioxips
• Petita seqüenciació del genoma
• Seqüenciació d’ARN petit i miRNA per ió Torrent
• Seqüenciació de l’ADN mitocondrial
• Anàlisi d’imatge d’espectres visibles i quimioluminescència

Anàlisi Bioinformàtica de genòmica:

• Identificació i anotació de variants germinals
• Identificació i anotació de variants somàtiques
• Quantificació de transcripcions i anàlisis d’expressió diferencial
• Assemblatge de novo del genoma sencer i del transcriptoma sencer.
• Anàlisi de metilació.
• Anàlisi de metagenòmica.
• Anàlisi de metatranscriptòmica.
• Anàlisi de microarrays.

Proteòmica:

• Caracterització de les interaccions proteïna-proteïna
• Identificació de proteïnes
• Quantificació del proteoma
• Quantificació ultra profunda del proteoma (fraccionament)
• Quantificació del fosfoproteoma
• Quantificació de modificacions post-traduccions d’una proteïna purificada
• Quantificació de proteïnes dirigida
• Identificació taxonòmica bacteriana per Biotyper

Metabolòmica, Lipidòmica i Glicòmica:

• Metabolòmica no dirigida.
• Metabolòmica dirigida > MetLC Amino Acid Extend
• Metabolòmica dirigida > MetLC Acilcarnitina
• Metabolòmica dirigida > Àcids biliars MetLC
• Metabolòmica dirigida > Àcids grassos de cadena curta MetLC
• Metabolòmica dirigida > MetLC Oxilipinas
• Metabolòmica dirigida > Poliamines MetLC
• Metabolòmica dirigida > MetLC Metilaminas
• Metabolòmica dirigida > Metabolisme energètic MetGC
• Metabolòmica dirigida > Àcids grassos MetGC
• Metabolòmica dirigida > Anàlisi personalitzada
• Lipidomics > MetLC Lipidomics – I.
• Lipidomics > MetLC Lipidomics – II.
• Lipidomics > MALDI Imaging Lipidomics.
• Glicòmica de plasma i teixits
• Perfil espectroscòpic de ressonància magnètica nuclear (1H-RMN)
• Anàlisi de ressonància magnètica nuclear (RMN) 13C, 31P i 19F
• Fluxòmica per ressonància magnètica nuclear 1H-RMN